Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc4O35988 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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