Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Opn1mwO35599 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Opn1mwO35599 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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