Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Casq1O09165 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Casq1O09165 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Casq1O09165 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Casq1O09165 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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