Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Degs1O09005 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Degs1O09005 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Degs1O09005 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Degs1O09005 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Degs1O09005 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Degs1O09005 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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