Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Eftud2O08810 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms