Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
MsmbO08540 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms