Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms