Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm21976J3QNN2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm21976J3QNN2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm21976J3QNN2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm21976J3QNN2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm21976J3QNN2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm21976J3QNN2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm21976J3QNN2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Gm21976J3QNN2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gm21976J3QNN2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm21976J3QNN2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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