Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
E030018B13RikJ3QMS9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms