Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm3336J3QMQ6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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