Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn34c3J3QJW5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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