Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ctns-202ENSMUST00000108476 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 4933427I04Rik-201ENSMUST00000097896 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pla2g6-210ENSMUST00000174021 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Phactr1-205ENSMUST00000128646 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ankmy1-202ENSMUST00000160548 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Apol7b-201ENSMUST00000089469 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Nfatc1-201ENSMUST00000035800 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms