Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Gm10378F6XQQ1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm10378F6XQQ1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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