Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lmod3E9QA62 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms