Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17727E9Q4V7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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