Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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Ccdc71lE9Q4T4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccdc71lE9Q4T4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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