Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3250E9Q1M3 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms