Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Myo5cE9Q1F5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms