Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf217D3YYI7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms