Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cspp1B2RX88 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms