Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Usf3B2RUQ2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms