Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prrt4B2RU40 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms