Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Uhrf1bp1B2KF50 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms