Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2al1jA2BFR3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms