Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Frmpd1A2AKB4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frmpd1A2AKB4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms