Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Myom3A2ABU4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Myom3A2ABU4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms