Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm5538W4VSP6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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