Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hdac5Q9Z2V6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hdac5Q9Z2V6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms