Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdac6Q9Z2V5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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