Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl40Q9Z2Q5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl40Q9Z2Q5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms