Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ubl3Q9Z2M6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms