Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf3Q9Z2L7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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