Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms