Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RfxankQ9Z205 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RfxankQ9Z205 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms