Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Skp2Q9Z0Z3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Skp2Q9Z0Z3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms