Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf4Q9QZS2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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