Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChmQ9QXG2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmQ9QXG2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms