Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim44Q9QXA7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trim44Q9QXA7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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