Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Csnk1eQ9JMK2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms