Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Trappc2lQ9JME7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms