Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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