Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Col5a3Q9JLI2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Col5a3Q9JLI2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Col5a3Q9JLI2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Col5a3Q9JLI2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Col5a3Q9JLI2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Col5a3Q9JLI2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Col5a3Q9JLI2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Col5a3Q9JLI2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms