Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkd2l2Q9JLG4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms