Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancaQ9JL70 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms