Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gde1Q9JL56 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms