Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ap3m1Q9JKC8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ap3m1Q9JKC8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms