Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scube2Q9JJS0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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