Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms