Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ush1cQ9ES64 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ush1cQ9ES64 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ush1cQ9ES64 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ush1cQ9ES64 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ush1cQ9ES64 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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