Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp29Q9ES63 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp29Q9ES63 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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